2023-03-29 　阅读：16　

动科院员工第二党支部第四次学术沙龙系列活动

本学期新开学，支部同学在疫情解封后重新回到校园。为拓展同学们科研知识并使支部同志能不忘初心，坚定学习信念，为新学期的科研学习打下基础。2月26日晚动科院员工第二党支部第四次学术沙龙系列活动，线下和线上形式同时进行。本次活动由支部研究生和晓明同志主讲，活动面向动物科学、蜂学、特种经济动物饲养三个专业的同学，活动流程为：汇报人讲解PPT——支部同志提问解答——交流学习心得。

和晓明同志以《牛朊蛋白基因（PRNP）23bp和12bp插入/缺失不同单倍型的分子调控网络解析及其新标记发掘》为题，首先向同学们分享了疯牛病（BSE）在人类健康和畜牧业发展中存在的威胁及其主效基因之一的PRNP基因上两个多态位点在BSE抗性上的作用为相关背景知识。主要通过讲解了为进一步筛选到提高BSE抗性以及影响、控制BSE的基因或分子标记，通过测序分析采集到的黄牛样本mtDNA D-loop高变区，构建NJ进化树初步筛选了Bos taurus属中甸黄牛655头，再检测了其中591头公牛的SRY基因序列，绘制中介网络图，分析其遗传多样性；再分别对所有黄牛PRNP基因的23和12bp indel进行鉴定，从23-12bp Indel的四种单倍型出发，分析不同单倍型下黄牛延髓样本中的mRNA和miRNA表达量差异，筛选以PRNP基因为核心下的抗BSE性状的新基因及其分子标记分析。通过结合生物信息学数据库预测分析、机器学习算法计算等多种方法，筛选差异mRNA、miRNA并分别重点构建了通过数据库预测差异mRNA的靶向miRNA和差异miRNA的靶向mRNA形成的mRNA-miRNA靶向关系网络；通过预测差异miRNA相关的lncRNA，构建lncRNA-miRNA-mRNA组成的ceRNA网络；预测差异基因之间的蛋白质-蛋白质互作，根据最大团中心性等五种算法筛选基因，筛选到MYH2、PCDH19、MYL2等10个候选基因并构建PPI网络；对这10个筛选到的基因进行特征基因筛选，使用Lasso回归和随机森林分析缩小到7个关键基因。通过实时荧光定量PCR、双荧光素酶报告基因验证，并对目标基因进行5’调控区的功能验证和SNPs筛选，在模式生物斑马鱼上进行CRISP-Cas9的基因敲除验证。

    整个试验运用了多种生物信息学分析方法，最终筛选出可能在BSE抗性中起到作用的新基因，并对其中关键的几个基因进行了初步的验证。研究BSE相关的基因和基因突变对于疾病预防、治疗和深入了解神经系统的发育和功能都具有重要的意义。

PPT讲解结束后，支部同学围绕相关问题展开讨论，和晓明同志对相关问题做了详细解答，本次活动开阔了同学们的眼界，了解了动物遗传育种与繁殖专业的相关研究方向，激励并提高支部同学的考研和考博兴趣，营造了浓厚的学术氛围。